ניתוח גנומי של התפרצות ראשונה של סלמונלה אנטריטידיס בתעשיית העופות בניו זילנד
מחקר חדש שפורסם בכתב העת Microbial Genomics חוקר את ההתפרצות המתועדת הראשונה של Salmonella Enteritidis (ובפרט זן ST11) בתעשיית העופות של ניו זילנד, אשר נקשרה הן לתחלואה בבני אדם והן לסביבת יצור של עופות. לפני שנת 2021, פתוגן זה לא אותר בלהקות עופות מקומיות, כאשר מקרים בבני אדם יוחסו בעבר באופן היסטורי לנסיעות לחו"ל.
החוקרים ניתחו 231 גנומים של S. Enteritidis ממקרים בבני אדם וממקורות בתעשיית העופות, ומצאו כי זן ההתפרצות הופיע סביב פברואר 2019. הנתונים הגנומיים הצביעו על הגברה והתפשטות משמעותית בתוך תעשיית העופות, כאשר אירועי הדבקה התרחשו בנקודות שונות לאורך שרשרת הייצור. ניתוח פילודינמי זיהה מדגריה ספציפית כמקור הסביר ביותר להפצת הזיהום.
ההתפרצות התפתחה לשלושה ענפים גנטיים (clades) נפרדים, דבר המצביע על שינוי בנתיבי ההדבקה לאורך זמן. ההדבקה המוקדמת (ענף 1) נקשרה בעיקר למשקי מטילות ביצי מאכל ולהתפרצות ספציפית במסעדה בשנת 2019. שלבים מאוחרים יותר של ההתפרצות (ענפים 2 ו-3) הראו מעבר לכיוון שלוחת הפטם. צעדי התערבות שננקטו בעקבות ממצאים אלה הוכתרו בהצלחה. והובילו לירידה משמעותית בדיווחים על מקרים בבני אדם.
זן ההתפרצות הספציפי (SE-19C01) יצר אשכול עצמאי והיה שונה גנטית מכל שאר גנומי S. Enteritidis ST11 בינלאומיים שנותחו, ממצא המחזק את המסקנה כי מדובר בחדירה ייחודית ומקומית. החוקרים מציינים כי בעוד שהמדגריה הייתה המקור הראשוני, נתיבי הדבקה אחרים (כגון מזון, ציוד או עובדים) תרמו ככל הנראה להתפשטות.
 |
 |
